Nhà đầu tư được đề nghị liên lạc với Bộ phận tiếp nhận hồ sơ hành chính sau ba ngày làm việc kể từ ngày nộp hồ sơ để nhận trả lời về tính hợp lệ của hồ sơ hoặc nhận yêu cầu bổ sung hoặc giải trình.
Khi nhà đầu tư nộp lại hồ sơ, HAPI có thể (i) thu lại phiếu giao nhận hồ sơ cũ và cấp một phiếu giao nhận hồ sơ mới hay (ii) chỉ rõ trong phiếu giao nhận hồ sơ cũ những tài liệu bổ sung đã được nộp. Thời gian tối đa theo quy định để cấp Giấy chứng nhận đầu tư sẽ được tính lại kể từ ngày nộp hồ sơ bổ sung.
Đối với những dự án thuộc diện thẩm tra cấp Giấy chứng nhận đầu tư (bao gồm Dự án có quy mô vốn từ 300 tỷ đồng Việt Nam trở lên) sau 03 ngày làm việc kể từ ngày nhà đầu tư nộp hồ sơ, nếu hồ sơ đủ điều kiện để thụ lý, HAPI sẽ xem xét và có công văn gửi các Bộ ngành có liên quan để xin ý kiến. Nhà đầu tư có thể được yêu cầu bổ sung hồ sơ theo yêu cầu của các Bộ ngành có liên quan.